Elektroforez gelining 1%-2% agaros jel konsentratsiyasi PCR mahsulotlarining 100-1000 bp oralig'idagi o'lchamlarini samarali ajratish uchun optimaldir. Agar gel elektroforezida 100 bp va 200 bp uzunlikdagi DNK fragmentlari aniqlansa, bu PCR reaksiyasi maqsadli DNKni aniq kuchaytirganligini ko'rsatadi.