2300 yillik kishlak Buholota, Aleksandr Makedonskiy tomonidan qo‘lga olindi va bir vaqtning o‘zida Kushan Imperiyasi tomonidan ham boshqarildi. Lekin, keyinroq Samanidlarning kuchga kirishi bilan, ular Buholotani poytaxt sifatida o‘zida yirik feudaliy davlat yaratishdi. Bu, Shimoliy va janubi koldiqi keng qadamlari uchrashuv punkti sifatida nomlangan Zarracha qismiga kirgan va bu orqali, savdo, diniylik va madaniyat uchun ajoyib markaz bo'ldi. Sanskrit tilida Bukhara "Monastir" deb ma'no bo‘lgan va Markaziy Musulmon Sharqining imon qutqaruvchisi sifatida hurmat qilingan edi. X yuz yillik, Bukhara ilmiy va madaniy markazga aylanadi, Rudaki, Dakiki kabi mashhur shoir va Al-Buxoriyning yashab yurgan joyiga aylandi, albatta, katta ilmiy va davlatshunos olim bo‘ldi. XIX asrning o‘rtalariga kelib, Rossiya va Britaniya ikkisi ham Markaziy Osiyoni egallashga harakat qildilar: Rossiya shimoldan va Britaniya Hindistonning janubidan. Zarracha yo‘lni yurmasidan buyon Markaziy Osiyo, g‘arblik sayohatkarlarini yuzlab yillardan beri ko‘rmagan edi. Ertalab Rossiya 1868-yilda mintaqaning ko‘proq qismini egallagan bo‘lsa-da, Bukhara xalqini egallagan Emirlarini o‘z joyida saqladi. O‘rtacha divarlarning ichida, g‘arbliklarga qarshi kuchkunchli pozitsiya daim mavjud edi, Emir o‘zi tomonidan havoga solindida. 1918-yilda Rossiyadagi inqilob O‘zbekistonga tarqalib, lekin Bukhara shahri shahar o‘z ichiga tortilmadi, balki qotib qolib, 1920 yil 6-sentyabrdagi Qizil Qo‘shnin katliamida, shahar haddan tashqari tarqatilgan va minglab odam o‘ldirildi.